En la Tierra, en un futuro cercano, la humanidad se enfrentó a la destrucción inminente de misteriosas criaturas gigantes conocidas como «Enormes». El mundo entero se une contra los Huge y desarrolla con éxito el armamento conocido como «CHARM» (Counter Huge Arms) mediante la combinación de ciencia y magia. CHARM exhibe altas tasas de sincronización con las adolescentes, y las niñas que usan CHARM son vistas como héroes llamados «Lirios».
En todo el mundo, las academias militares «Jardín» se establecen para entrenar a los Lirios para enfrentar a los Enormes y servir como bases para proteger y guiar a las personas. Riri Hitotsuyanagi logró aprobar el examen para ingresar al prestigioso Jardín conocido como Yurigaoka Girls ‘School. Entró en un intento de encontrar a Yuyu Shirai, una chica que la rescató en su pasado. Esta es una historia sobre Riri y otras chicas que aspiran a convertirse en lirios en uno de esos jardines.